Table 2

Detection of selected genes of the cag PAI in clinical strains of H pylori

Strain	Diagnosis	ORF6	ORF10	ORF13	cagT	cagM	cagE	cagA	tnpA	tnpB
1	DU	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
3	DU	−	−	−	−	−	+	+	−	−
4	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
5	DU	+	+	+	+	+	+	+	+	+
6	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
7	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
8	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
9	DU	+	+	+	+	+	+	+	+	−
10	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
11	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
12	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
13	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
14	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
15	DU	−	−	−	−	+	+	+	−	−
16	DU	+	+	+	+	+	+	+	+	+
17	DU	−	−	−	−	−	−	−	−	−
18	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
19	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
20	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
21	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
22	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
23	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
24	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
25	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
26	DU	−	−	−	−	−	−	−	−	−
27	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
28	DU	+	+	+	+	−	−	−	−	−
29	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	+
30	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
31	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
32	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
33	NUD	+	+	+	+	+	+	+	−	−
34	DU	+	+	+	+	+	+	+	+	+
35	NUD	−	−	−	−	−	−	−	−	−
36	DU	−	−	−	−	−	−	−	−	−
37	NUD	−	−	−	−	−	−	−	−	−
38	NUD	+	+	+	+	+	+	+	+	+
39	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
40	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
41	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
42	NUD	−	−	−	−	−	+	+	+	+
43	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
44	NUD	+	+	+	+	+	+	+	−	−
45	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
46	NUD	−	−	−	−	−	−	−	−	−
47	NUD	−	−	−	−	+	+	+	+	+
48	DU	−	+	+	+	+	+	+	−	−
49	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
50	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
51	NUD	+	+	+	+	+	+	+	−	−
52	NUD	+	+	+	+	+	+	+	+	+
53	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
54	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
55	DU	−	+	+	+	+	+	+	+	+
56	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
57	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
58	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
59	NUD	−	+	+	+	+	+	+	−	−
60	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
61	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
62	DU	−	−	−	−	−	−	−	−	−
63	DU	+	+	+	+	+	+	+	+	+
64	NUD	−	−	−	−	−	−	−	−	−
65	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
66	NUD	+	+	+	+	+	+	+	−	−
67	NUD	+	+	+	+	+	+	+	−	−
68	NUD	−	−	−	−	+	+	+	−	−
69	DU	−	−	−	−	−	+	+	+	+
70	NUD	+	+	+	+	+	+	+	−	−
71	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
72	DU	+	+	+	+	+	+	+	−	−
73	NUD	−	−	−	−	+	+	+	−	−

DU, duodenal ulcer; NUD, non-ulcer dyspepsia.